Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM05

Pias4, E3 SUMO-protein ligase PIAS4, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pias4Q9JM05 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pias4Q9JM05 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pias4Q9JM05 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pias4Q9JM05 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pias4Q9JM05 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pias4Q9JM05 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pias4Q9JM05 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pias4Q9JM05 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pias4Q9JM05 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pias4Q9JM05 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pias4Q9JM05 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pias4Q9JM05 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pias4Q9JM05 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pias4Q9JM05 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pias4Q9JM05 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pias4Q9JM05 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pias4Q9JM05 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pias4Q9JM05 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms