Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cul3Q9JLV5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms