Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc4apQ9JLV2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc4apQ9JLV2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc4apQ9JLV2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc4apQ9JLV2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms