Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tnfrsf19Q9JLL3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tnfrsf19Q9JLL3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tnfrsf19Q9JLL3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf19Q9JLL3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Tnfrsf19Q9JLL3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Tnfrsf19Q9JLL3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf19Q9JLL3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms