Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
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Tgm1Q9JLF6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tgm1Q9JLF6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm1Q9JLF6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms