Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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SacsQ9JLC8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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SacsQ9JLC8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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SacsQ9JLC8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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SacsQ9JLC8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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SacsQ9JLC8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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SacsQ9JLC8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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SacsQ9JLC8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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SacsQ9JLC8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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SacsQ9JLC8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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SacsQ9JLC8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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