Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Nectin3Q9JLB9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Nectin3Q9JLB9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nectin3Q9JLB9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Nectin3Q9JLB9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Nectin3Q9JLB9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Nectin3Q9JLB9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Nectin3Q9JLB9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Nectin3Q9JLB9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Nectin3Q9JLB9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Nectin3Q9JLB9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Nectin3Q9JLB9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nectin3Q9JLB9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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