Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CubnQ9JLB4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms