Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldb3Q9JKS4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms