Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx5Q9JKQ4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx5Q9JKQ4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms