Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chrac1Q9JKP8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrac1Q9JKP8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms