Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rcan3Q9JKK0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.1 ms