Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem1Q9JKE2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms