Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ap3m1Q9JKC8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ap3m1Q9JKC8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms