Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Uchl3Q9JKB1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Uchl3Q9JKB1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Uchl3Q9JKB1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uchl3Q9JKB1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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