Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc86Q9JJ89 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms