Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc12a4Q9JIS8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms