Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn12Q9ET43 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms