Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Pgpep1Q9ESW8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Pgpep1Q9ESW8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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Pgpep1Q9ESW8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pgpep1Q9ESW8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pgpep1Q9ESW8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pgpep1Q9ESW8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pgpep1Q9ESW8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Pgpep1Q9ESW8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Pgpep1Q9ESW8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Pgpep1Q9ESW8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pgpep1Q9ESW8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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