Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms