Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ush1cQ9ES64 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ush1cQ9ES64 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ush1cQ9ES64 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ush1cQ9ES64 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ush1cQ9ES64 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ush1cQ9ES64 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ush1cQ9ES64 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ush1cQ9ES64 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ush1cQ9ES64 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ush1cQ9ES64 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ush1cQ9ES64 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms