Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Tlnrd1Q9ERE8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tlnrd1Q9ERE8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 206.3 ms