Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snap29Q9ERB0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms