Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tfcp2Q9ERA0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tfcp2Q9ERA0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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