Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms