Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ52

Vmn1r48, Vomeronasal type-1 receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r48Q9EQ52 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r48Q9EQ52 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r48Q9EQ52 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms