Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms