Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnft1Q9DCN7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms