Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE9

Igtp, Interferon gamma-induced GTPase, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IgtpQ9DCE9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IgtpQ9DCE9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms