Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MNCb-2875Q9DCB3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms