Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde1Q9DBZ9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Syde1Q9DBZ9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde1Q9DBZ9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms