Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxp4Q9DBY0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms