Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrpraQ9DBG7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms