Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tysnd1Q9DBA6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tysnd1Q9DBA6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms