Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap1s2Q9DB50 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms