Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med27Q9DB40 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Med27Q9DB40 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Med27Q9DB40 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Med27Q9DB40 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms