Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB15

Mrpl12, 39S ribosomal protein L12, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl12Q9DB15 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl12Q9DB15 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mrpl12Q9DB15 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl12Q9DB15 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl12Q9DB15 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl12Q9DB15 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl12Q9DB15 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl12Q9DB15 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl12Q9DB15 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl12Q9DB15 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl12Q9DB15 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl12Q9DB15 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl12Q9DB15 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl12Q9DB15 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl12Q9DB15 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl12Q9DB15 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl12Q9DB15 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl12Q9DB15 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl12Q9DB15 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl12Q9DB15 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl12Q9DB15 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl12Q9DB15 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl12Q9DB15 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl12Q9DB15 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl12Q9DB15 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl12Q9DB15 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl12Q9DB15 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl12Q9DB15 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl12Q9DB15 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl12Q9DB15 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl12Q9DB15 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms