Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhobtb1Q9DAK3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms