Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms