Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdzd9Q9D9M4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd9Q9D9M4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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