Protein–RNA interactions for Protein: Q9D898

Arpc5l, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5lQ9D898 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms