Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rep15Q9D7T1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rep15Q9D7T1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rep15Q9D7T1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rep15Q9D7T1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rep15Q9D7T1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rep15Q9D7T1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rep15Q9D7T1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rep15Q9D7T1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rep15Q9D7T1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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