Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Chmp4cQ9D7F7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp4cQ9D7F7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms