Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl40Q9D783 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms