Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G3

2900055J20Rik, RIKEN cDNA 2900055J20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2900055J20RikQ9D6G3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2900055J20RikQ9D6G3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2900055J20RikQ9D6G3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2900055J20RikQ9D6G3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms