Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc9bQ9D6E4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc9bQ9D6E4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc9bQ9D6E4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc9bQ9D6E4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc9bQ9D6E4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc9bQ9D6E4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc9bQ9D6E4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Ttc9bQ9D6E4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc9bQ9D6E4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc9bQ9D6E4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc9bQ9D6E4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc9bQ9D6E4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc9bQ9D6E4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc9bQ9D6E4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Ttc9bQ9D6E4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc9bQ9D6E4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc9bQ9D6E4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc9bQ9D6E4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc9bQ9D6E4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc9bQ9D6E4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc9bQ9D6E4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
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Ttc9bQ9D6E4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc9bQ9D6E4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc9bQ9D6E4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc9bQ9D6E4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Ttc9bQ9D6E4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Ttc9bQ9D6E4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Ttc9bQ9D6E4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttc9bQ9D6E4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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