Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ptp4a3Q9D658 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptp4a3Q9D658 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptp4a3Q9D658 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptp4a3Q9D658 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ptp4a3Q9D658 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ptp4a3Q9D658 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptp4a3Q9D658 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ptp4a3Q9D658 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptp4a3Q9D658 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ptp4a3Q9D658 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptp4a3Q9D658 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptp4a3Q9D658 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptp4a3Q9D658 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ptp4a3Q9D658 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptp4a3Q9D658 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ptp4a3Q9D658 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptp4a3Q9D658 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ptp4a3Q9D658 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptp4a3Q9D658 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptp4a3Q9D658 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptp4a3Q9D658 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ptp4a3Q9D658 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptp4a3Q9D658 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ptp4a3Q9D658 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ptp4a3Q9D658 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptp4a3Q9D658 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptp4a3Q9D658 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptp4a3Q9D658 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptp4a3Q9D658 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptp4a3Q9D658 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptp4a3Q9D658 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptp4a3Q9D658 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ptp4a3Q9D658 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ptp4a3Q9D658 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptp4a3Q9D658 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptp4a3Q9D658 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ptp4a3Q9D658 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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