Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc39Q9D5Y1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms