Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3a3Q9D554 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3a3Q9D554 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms