Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc83Q9D4V3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms